Ekde ĝia malkovro en Ĝibutio en 2012, la azia moskito *Anopheles stephensi* disvastiĝis tra la Korno de Afriko. Ĉi tiu invada vektoro daŭre disvastiĝas tra la kontinento, prezentante gravan minacon al programoj pri malario-kontrolo. Metodoj de vektora kontrolo, inkluzive de insekticid-traktitaj litretoj kaj endoma resta ŝprucado, signife reduktis la ŝarĝon de malario. Tamen, la kreskanta tropezo de insekticid-rezistemaj moskitoj, inkluzive de populacioj de *Anopheles stephensi*, malhelpas daŭrantajn klopodojn por elimini malarion. Kompreni la strukturon de la populacio, genfluon inter populacioj kaj la distribuon de mutacioj kun insekticid-rezisteco estas esenca por gvidi efikajn strategiojn por malario-kontrolo.
Plibonigi nian komprenon pri kiel An. stephensi tiel establiĝis en la domanaro estas esenca por antaŭdiri ĝian eblan disvastiĝon al novaj areoj. Populacia genetiko estis vaste uzata por studi vektorspeciojn por akiri komprenon pri populacia strukturo, daŭranta selektado kaj genfluo18,19. Por An. stephensi, studi populacian strukturon kaj genoman strukturon povas helpi klarigi ĝian invadan vojon kaj ajnan adaptan evoluon, kiu eble okazis ekde ĝia apero. Aldone al genfluo, selektado estas aparte grava ĉar ĝi povas identigi alelojn asociitajn kun insekticida rezisto kaj klarigi kiel ĉi tiuj aleloj disvastiĝas tra la populacio20.
Ĝis nun, testado de insekticidaj rezistaj indikiloj kaj populacia genetiko ĉe la enpenetra specio Anopheles stephensi limiĝis al kelkaj kandidatgenoj. La apero de la specio en Afriko ne estas plene komprenata, sed unu hipotezo estas, ke ĝi estis enkondukita de homoj aŭ brutaro. Aliaj teorioj inkluzivas longdistancan migradon per vento. La etiopiaj izolitaĵoj uzitaj en ĉi tiu studo estis kolektitaj en Awash Sebat Kilo, urbo situanta 200 km oriente de Adis-Abebo kaj sur la ĉefa transportkoridoro de Adis-Abebo al Ĝibutio. Awash Sebat Kilo estas areo kun alta malario-dissendo kaj havas grandan populacion de Anopheles stephensi, kiu laŭdire estas rezistema al insekticidoj, igante ĝin grava loko por studi la populacian genetikon de Anopheles stephensi8.
La insekticida rezista mutacio kdr L1014F estis detektita malaltfrekvence en la etiopa populacio kaj ne estis detektita en la hindaj kampaj specimenoj. Ĉi tiu kdr-mutacio donas reziston al piretroidoj kaj DDT kaj estis antaŭe detektita en An. stephensi-populacioj kolektitaj en Barato en 2016 kaj Afganio en 2018.31,32 Malgraŭ indikoj pri ĝeneraligita piretroida rezisto en ambaŭ urboj, la kdr L1014F-mutacio ne estis detektita en la populacioj de Mangalore kaj Bengaluro analizitaj ĉi tie. La malalta proporcio de etiopaj izolitaĵoj portantaj ĉi tiun SNP-on, kiuj estis heterozygotaj, sugestas, ke la mutacio aperis ĵus en ĉi tiu populacio. Ĉi tion subtenas antaŭa studo en Awash, kiu ne trovis signojn de la kdr-mutacio en specimenoj kolektitaj en la jaro antaŭ tiuj analizitaj ĉi tie.18 Ni antaŭe identigis ĉi tiun kdr L1014F-mutacion je malalta frekvenco en aro de specimenoj el la sama regiono/jaro uzante amplikonan detektan metodon.28 Konsiderante la fenotipan reziston ĉe la specimeniglokoj, la malalta alela frekvenco de ĉi tiu rezistancmarkilo sugestas, ke mekanismoj krom la modifo de la cela loko respondecas pri ĉi tiu observita fenotipo.
Limigo de ĉi tiu studo estas la manko de fenotipaj datumoj pri la respondo al insekticido. Pluaj studoj kombinantaj tutgenoman sekvencadon (WGS) aŭ celitan amplikonan sekvencadon kombine kun bioanalizoj de malsaniĝemeco estas necesaj por esplori la efikon de ĉi tiuj mutacioj sur la respondon al insekticido. Ĉi tiuj novaj misencaj SNP-oj, kiuj eble estas asociitaj kun rezisto, devus esti celitaj por alt-trairaj molekulaj analizoj por subteni monitoradon kaj faciligi funkcian laboron por kompreni kaj validigi eblajn mekanismojn asociitajn kun rezistaj fenotipoj.
Resumante, ĉi tiu studo provizas pli profundan komprenon pri la genetiko de la populacioj de la moskitoj Anopheles tra kontinentoj. Apliko de analizo de tuta genoma sekvencado (WGS) al pli grandaj kohortoj de specimenoj en malsamaj geografiaj regionoj estos ŝlosila por kompreni genan fluon kaj identigi signojn de rezisto al insekticidoj. Ĉi tiu scio ebligos al la aŭtoritatoj pri publika sano fari informitajn elektojn pri vektora gvatado kaj uzo de insekticidoj.
Ni uzis du alirojn por detekti variadon de kopinombraj datumoj en ĉi tiu datumbazo. Unue, ni uzis kovro-bazitan aliron, kiu fokusiĝis al identigitaj CYP-genaj aretoj en la genaro (Aldona Tabelo S5). Specimena kovro estis averaĝita tra kolektaj lokoj kaj dividita en kvar grupojn: Etiopio, hindaj kampoj, hindaj kolonioj kaj pakistanaj kolonioj. La kovro por ĉiu grupo estis normaligita uzante kernan glatigon kaj poste grafike prezentita laŭ la mediana genoma kovroprofundo por tiu grupo.
Afiŝtempo: 23-a de junio 2025